Vid Umeå universitet finns världsledande forskning inom flera områden. Vi erbjuder ett attraktivt utbud av utbildningar och goda studiemiljöer. Campus utgör en inspirerande miljö för de 4 200 anställda och 36 700 studenter som valt oss. För oss är det självklart att sträva efter jämställdhet och mångfald. Vi samarbetar gärna med näringsliv och organisationer i regionen och övriga världen. Tillsammans står vi inför spännande utmaningar och stora möjligheter.

Doktorandtjänst i kemi med inriktning mot teoretisk biofysik

Vi söker en begåvad och entusiastisk doktorand som ska forska och doktorera i projektet ”Molekylära simuleringar av biologiska processer hos proteinkinaser och peroxiredoxiner”

Projektbeskrivning:
Protein dynamik är en avgörande faktor för proteiners funktion, inklusive protein binding/ dissociation, veckning, aggregering och enzymkatalys, och man tror att många sjukdomar utvecklas pga störd protein dynamik. Trots betydelsen av protein dynamik för förståelse av cellulär funktioner och sjukdomar, är de grundläggande principerna för samspelet mellan protein dynamik och funktion fortfarande oklara. Detta begränsar utvecklingen av nya terapeutiska metoder för behandling av sjukdomar, såsom cancer och Alzheimers sjukdom. I min forskningsgrupp försöker vi bestämma rollen av dynamik för proteiners funktion genom teoretiska metoder och avancerade beräkningar, vilket är det enda sätt som kan ge detaljerad information på atomär nivå. Vårt primära fokus är proteinkinaser och perioxiredoxiner, eftersom dessa typer av proteiner är inblandade i cancer och andra sjukdomar, dvs de har betydande biofysiska och medicinska intressen. Vi utvecklar också nya simuleringsmetoder och modeller för att underlätta studierna.

Det forskningsprojekt som den utvalde sökanden kommer att arbeta med innebär karakterisering av konformationsändringar och katalytiska mekanismer hos proteinkinaser. Detta arbete kommer att innebära state-of-the-art datorsimuleringstekniker, inklusive men inte begränsat till molekylär modellering, molekyldynamiska simuleringar och kvantmekanik. Projektet kommer att genomföras med hjälp av högpresterande datorer som finns på HPC2N (http://www.hpc2n.umu.se).
 

Förkunskaper:
För att söka doktorandutbildningsplatsen krävs antingen i) 240 högskolepoäng av högre akademisk utbildning där 60 p måste vara på master nivå (avancerad nivå) inom kemi eller biofysik, eller ii) 120 gamla poäng och som motsvarar 180 högskolepoäng inom högre universitetsutbildning vilka har avslutats före 1/7 2007 eller motsvarande kompetens.
Avancerade kurser eller annan erfarenhet av dator programmering, avancerade simuleringar och beräkningar, och/eller NMR och röntgen kristallografi är av värde, liksom goda kunskaper i engelska, både tal och skrift.

Ansökan:
Ansökan skall innehålla ett CV, akademiska examina, akademiska kurser som slutförts med betyg samt annan information som sökande anser vara relevant. En personlig beskrivning av sökande och motivering varför du söker denna utbildningsplats ska bifogas. Kontakt information för minst två referens personer, som känner till sökandes kvalikationer ska bifogas. Handlingar som skickas elektroniskt ska vara i word- eller pdf-format.
Vi eftersträvar en jämställd könsfördelning vid institutionen och ser gärna kvinnliga sökande.
Närmare upplysningar lämnas av Dr. Kwangho Nam, phone +46 (0)90 786 65 70, e-mail:  Kwangho.Nam@chem.umu.se.
Facklig information lämnas av SACO, tel 090-786 53 65, SEKO, tel 090-786 52 96 samt ST, tel 090-786 54 31.

Ansökningstiden för denna tjänst har passerat.

Umeå University - with its 36,700 students and over 4,200 employees - is an organisation in constant change and development. Umeå University conducts groundbreaking research within several areas - several in which we are among the best in the world - within others regarded as the leaders in Sweden. We are one of Sweden’s largest providers of education and offer a broad and attractive range of courses and programmes. Our campus constitutes an inspiring environment for everyone that studies and works here. We wish to co-operate with companies and organizations throughout the Umeå region and all over the world.

PhD Student Position in Chemistry with focus on computational biophysics

We seek a highly creative and motivated PhD student to work within the project ‘Molecular simulations of biological processes of protein kinases and peroxiredoxins.’

Project description:
Protein dynamics is a crucial element in protein function, including protein association/dissociation, folding, aggregation, and enzyme catalysis, and many diseases are implicated to develop by disrupting protein dynamics.  However, despite the importance of protein dynamics on cellular function and diseases, the fundamental principles of the interplay between protein dynamics and function are less understood.  This limits the development of new therapeutic approaches treating diseases, such as, cancer and Alzheimer’s disease.  In my research lab, we aim to unravel the roles of protein dynamics on function by applying theory and high level computations.  Computational approaches are currently the only way yielding detailed information at the atomic level.  Our primary targets are protein kinases and perioxiredoxins, as they are implicated in cancer and other diseases, thus, having important biophysical and medicinal interests.  We also actively develop new simulation techniques and models to facilitate the study. 

The research project that the successful applicant will work on involves the characterization of conformational dynamics of protein kinases and catalytic mechanisms involved in the function of kinase.   This work will involve state-of-the-art computer simulation techniques, including but not limited to molecular modeling, molecular dynamics simulations, and quantum mechanics.  The project will be carried out by using high performance computers available at HPC2N (http://www.hpc2n.umu.se).   

Prerequisites:
The recruitment procedure will follow the Higher Education Ordinance (”Högskoleförordningen” Chapters 5 and 7). Prerequisites include either i) 240 ECTS credits (Swe. Högskolepoäng) of higher education studies of which 60 should be on an advanced level (Master level) with focus on chemistry or biophysics or ii) 120 Swedish (old) credits (Swe. Poäng; corresponding to 180 ECTS credits) of higher education studies if they were taken before July 1, 2007 or equivalent competence.
Advanced course(s) or experiences in computer programming, high-performance computations, and/or NMR or X-ray spectroscopy are a plus, as well as evidence of proficiency in written and oral communication in English. 

Application:
The application should contain a CV, including academic grades and relevant documentation, and a personal letter describing yourself and your reasons for applying to this position.  Contact information of at least two referees, familiar with the applicant’s qualifications should be provided.  Documents should preferably be sent electronically and should be in MS Word or PDF format.  Since we strive for a more equal gender distribution within our department, we especially encourage female applicants.

For more information please contact:
Dr. Kwangho Nam, phone +46 (0)90 786 65 70, e-mail:  Kwangho.Nam@chem.umu.se

The procedure for recruitment for the position is in accordance with the Higher Education Ordinance (chapter. 12, 2 §) and the decision regarding the position cannot be appealed. Union information is available from SACO, +46-(0)90-786 53 65, SEKO, +46-(0)90-786 52 96 and ST, +46-(0)90-786 54 31.

The application period for this advert has expired.