Vid Umeå universitet finns världsledande forskning inom flera områden. Vi erbjuder ett attraktivt utbud av utbildningar och goda studiemiljöer. Campus utgör en inspirerande miljö för de 4 200 anställda och 36 700 studenter som valt oss. För oss är det självklart att sträva efter jämställdhet och mångfald. Vi samarbetar gärna med näringsliv och organisationer i regionen och övriga världen. Tillsammans står vi inför spännande utmaningar och stora möjligheter.

Postdoktor (2 år) i bioinformatik

vid Kemiska institutionen och Computational Life Science Cluster (CliC)

Inom KAW-projektet ”Från släktforskning till jäst, sökandet efter gener kopplade till tjocktarmscancer med ett tvärvetenskapligt angreppssätt ” bedrivs forskning med mål att på molekylär nivå förstå tjocktarmscancer. Här deltar fyra forskargrupper med kompetens i onkologi, genetik, bioinformatik, DNA-reparation och DNA-replikation. I projektet studeras arvsmassan i friska celler, inte tumörceller, från individer som utvecklat ärftlig tjocktarmscancer. Kartläggningar med storskalig DNA-sekvensering har skapat stora möjligheter att identifiera de gemensamma, sjukdomsframkallande, mutationerna. Dessa kommer vi i sin tur att analysera i olika modellsystem för att förstå mekanismerna till tjocktarmscancer.

 
Till detta projekt söker vi nu en postdoktor för att självständigt hantera och utveckla metoder och programvaror för att organisera och analysera data från storskalig DNA-sekvensering av prover från blod. Anställningen omfattar två år och är på heltid.

Kompetenskrav
Vi söker dig som har en högst tre år gammal doktorsexamen, eller motsvarande, inom bioinformatik, bioteknik, genomik, datavetenskap, statistik eller relaterat område. Du har dokumenterat god kunskap i minst ett relevant scriptspråk (R, Python, Perl, C) samt kunskap om de beräkningsvetenskapliga metoder som används för analys av Illumina/454/Solid-sekvenseringsdata. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom samarbets- och kommunikationsförmåga, samt pedagogisk och analytisk förmåga. Det är viktigt att du har har god initiativförmåga och förmåga till självständigt arbete. Projektet bedrivs i en tvärvetenskaplig miljö, och därför krävs mycket god kompetens i muntlig och skriftlig kommunikation på engelska. Postdoktoral erfarenhet är meriterande.

Ansökan

Till ansökan ska bifogas (1) en meritförteckning (CV), (2) kopior av examensbevis och publikationer, (3) namn och kontaktuppgifter till minst tre referenspersoner samt (4) ett följe/ansökningsbrev med motivering. Ansökan kan antingen inlämnas elektroniskt (handlingar i word- eller pdf-format) eller i pappersformat (2 kopior).

Närmare upplysningar kan lämnas av adj professor Beatrice Melin, onkologiska institutionen, tel 090-785 13 59, beatrice.melin@onkologi.umu.se eller universitetslektor Johan Trygg, kemiska institutionen, tel, 090 786 69 17, johan.trygg@chem.umu.se

Facklig information lämnas av SACO, tel 090-786 53 65, SEKO, tel 090-786 52 96 samt ST, tel 090-786 54 31.

Ansökningstiden för denna tjänst har passerat.

Umeå University - with its 36,700 students and over 4,200 employees - is an organisation in constant change and development. Umeå University conducts groundbreaking research within several areas - several in which we are among the best in the world - within others regarded as the leaders in Sweden. We are one of Sweden’s largest providers of education and offer a broad and attractive range of courses and programmes. Our campus constitutes an inspiring environment for everyone that studies and works here. We wish to co-operate with companies and organizations throughout the Umeå region and all over the world.

Postdoc Position (2 years) in Bioinformatics

at the Department of Chemistry and Computational Life Science Cluster (CliC)

Within the large KAW project " From genealogy to yeast; the search for colon cancer genes with a multidisciplinary approach" the aim is to identify mutations which give a predisposition for colon cancer and to understand why this is the case at the molecular level. There have been several attempts made to understand the genetics of the cancer cell through whole genome sequencing. However, by simply comparing mutations found in a tumor cell with those found in healthy tissue it is not possible to determine which mutation was the driving factor leading to the development of the tumor cell. Our unique approach is to analyze not the tumor cells but, instead, to look at healthy somatic cells in individuals that have developed familial colon cancer. The strength of this project also lies in the multidisciplinary competence of the participating investigators. Four research groups are involved with expertise in oncology, genetics, bioinformatics and DNA repair/replication systems. Mapping the genome using next generation sequencing technologies has created great opportunities to identify common, disease-causing mutations. These will in turn be analyzed in different model systems for understanding the molecular mechanisms of colon cancer.

To this project, we are now searching for a person who can independently manage next generation sequencing data, develop methods and use existing software pipelines for organizing and analyzing such data from human samples. The position is full time and for a period of two years.

Competence requirements
To be eligible for the position you should have a PhD, or equivalent, in bioinformatics, biotechnology, genomics, computer science, statistics or related field, which is not more than three years old. You have documented good knowledge of at least one relevant scripting language (R, Python, Perl, C), and knowledge of the computational methods used in the analysis of Illumina/454/Solid sequencing data. Emphasis will also be placed on personal qualities such as collaboration and communication skills, analytical capacity and ability to take initiative. It is important that you have a good sense of initiative, and an ability to work independently. You will work in a multidisciplinary environment and, therefore, very good oral and written communication skills in English are required. Postdoctoral experience is a merit.

The application
The application should include (1) a Curriculum Vitae, (2) copies of degree certificates and publications, (3) names and contact information to at least three reference persons and (4) a cover letter with a motivation. The application can be submitted either electronically (MS Word or PDF format) or in hard-copy (two copies) form.

For further information please contact adjunct professor Beatrice Melin, Oncology Department, tel: +46 (0)90-785 13 59, beatrice.melin@onkologi.umu.se or associate professor Johan Trygg, Department of Chemistry, tel, +46 (0)90-786 69 17, johan.trygg@chem.umu.se.

Union related information is available from SACO, phone +46 (0)90-786 53 65, SEKO, phone +46 (0)90-786 52 96 and ST, phone +46 (0)90-786 54 31

The application period for this advert has expired.